急性附睾炎对人体的危害非常大，药物治疗是常见的治疗方式。患者在确诊急性附睾炎后，应根据自己的病情选择适当的治疗方案，药物的选择应适合患者的身体情况。
急性附睾炎是一种非特异性感染，是阴囊最常见的感染性疾病。其病原菌多是由肠道细菌或铜绿假单胞菌引起。因此，在治疗时应使用抗菌药物。
抗菌药物的选择应通过细菌培养和药敏试验来确定。如果病人对甲氧苄氨嘧啶过敏，可每天口服两次，持续四周。如果局部发红明显、血细胞增多、体温升高，应静脉滴注抗生素；如果体温正常，可改用口服抗生素。
急性附睾炎患者还应接受支持性治疗，如卧床休息和阴囊支撑。如果附睾疼痛较重，可在睾丸所处的精索局部注射1%利多卡因20毫升以缓解不适，也可口服止痛和退热药。在附睾发炎早期可以使用冰袋，以防止肿胀；后期可采用热敷，加速炎症的消失，减轻不适感。有时，莫西芬也可用来减轻疼痛和缓解症状。在急性期避免性生活和体育活动，以免加重感染症状。
上面已经详细描述了药物治疗急性附睾炎的方法。除药物治疗外，还有其他许多药物可用于配合治疗急性附睾炎。